判断大分子主链的共轭程度”
“不能把整个大分子弄进去吗?”许秋道
“因为是模拟计算,你输入的原子数量越多,计算的复杂度就越高,所需要的算力越多
我们又没有超算,平时算一两个结构片段都要半个小时,把整个分子都弄进去不得算上一个月”
许秋心中盘算着能不能用系统升级一下DFT模拟计算的功能,不过这是之后的事情了,DFT的流程还没有学完
“学姐,怎么画分子结构呢”许秋道
“哎呀,说了这么多,最重要事情的忘记教你了”陈婉清尴尬道:
“要先去学校正版软件那里下载ChemBioOffice软件包,里面有很多的软件
我们要用到的是Chemdraw软件,这是专门用来画分子结构的,不过,软件包有些大,你先用我的电脑画吧”
陈婉清打开软件,一边示范,一边讲解:
“操作起来很简单,先选择一个ACS的模板,然后像画图一样把分子结构画出来就行了
常用的苯环、噻吩环、碳碳单键、双键都有预设的图形,点击一下就能自动绘制
像我们平常在文献中看到的分子结构基本都是用这个软件做出来的
怎么样学弟,你学废了吗?”
“学会了,看着确实挺简单的”许秋点点头
“好呀,画完分子结构后,导出成.cdx格式的文件,就可以进行DFT模拟了”陈婉清道:
“当然也可以用其他ChemBioOffice的软件打开,比如Chem3D,可以看到所绘制分子的球棍模型或者原子模型”
……
两人将各自的分子结构画好后,拷贝到U盘中,前往魏老师办公室
“怎么样,循环水修好了吗?”魏兴思问道
“修好了,漏水原因是……”
许秋说了一半,看到陈婉清在疯狂给他使眼色
他心思急转,莫非学姐是那个意思?
他继续道:
“是橡胶圈老化导致的,现在已经更换了新的橡胶圈,往储水舱中重新加了去离子水,已经不漏水了”
“修好了就行,你们有其他的事吗?”魏兴思道
“我们是来做DFT模拟的”陈婉清道
“行,你去操作吧”魏兴思道
陈婉清打开软件,以及TXT格式的软件操作说明书,一步步的对照着说明书操作,可以看出她也不是很熟练
许秋复制了学姐的DFT技能、ChemBioOffice软件使用技能,并将大电脑复制到模拟实验室中
DFT模拟一次只能计算一个分子结构
因此,软件启动后,两人便离开了
回到
“学弟刚才反应蛮快的嘛,领会到我的意思了?”陈婉清赞许道
“当时就几秒的时间,哪能考虑那么多,我就是觉得多说多错,所以就只是简单的说了下原因”许秋道
“是这样的,实验室里有很多